Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MESP1Q9BRJ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MESP1Q9BRJ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms