Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TXNDC17Q9BRA2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TXNDC17Q9BRA2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms