Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTP3Q9BQQ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTP3Q9BQQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms