Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGME1Q9BQP7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms