Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRG3Q99928 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRG3Q99928 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms