Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
MEIS3Q99687 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MEIS3Q99687 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS3Q99687 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms