Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
POP1Q99575 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
POP1Q99575 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POP1Q99575 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
POP1Q99575 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POP1Q99575 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POP1Q99575 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POP1Q99575 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POP1Q99575 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POP1Q99575 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POP1Q99575 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP1Q99575 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP1Q99575 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP1Q99575 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP1Q99575 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP1Q99575 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP1Q99575 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POP1Q99575 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms