Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPXM1Q96SM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPXM1Q96SM3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPXM1Q96SM3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPXM1Q96SM3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPXM1Q96SM3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms