Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
IFT140Q96RY7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
IFT140Q96RY7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
IFT140Q96RY7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
IFT140Q96RY7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms