Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCCC1Q96RQ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCCC1Q96RQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms