Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCNAQ96QF7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms