Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC4A9Q96Q91 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC4A9Q96Q91 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC4A9Q96Q91 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms