Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP3Q96P47 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP3Q96P47 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms