Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNDC3BQ96NL0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3BQ96NL0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3BQ96NL0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms