Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC42Q96M95 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC42Q96M95 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC42Q96M95 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC42Q96M95 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC42Q96M95 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC42Q96M95 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC42Q96M95 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC42Q96M95 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms