Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX27Q96L92 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX27Q96L92 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms