Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LOXL4Q96JB6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LOXL4Q96JB6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms