Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RAX2Q96IS3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAX2Q96IS3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms