Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCED1BQ96HM7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCED1BQ96HM7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms