Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRELD1Q96HD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRELD1Q96HD1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms