Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BORCS6Q96GS4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BORCS6Q96GS4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms