Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZDHHC12Q96GR4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZDHHC12Q96GR4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms