Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAP3Q96FM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGAP3Q96FM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms