Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MALSU1Q96EH3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MALSU1Q96EH3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms