Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP4Q96DX8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP4Q96DX8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP4Q96DX8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms