Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM44Q96DX7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM44Q96DX7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms