Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHISA4Q96DD7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA4Q96DD7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.6 ms