Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRC39Q96DD0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC39Q96DD0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms