Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECHDC3Q96DC8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ECHDC3Q96DC8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC3Q96DC8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC3Q96DC8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ECHDC3Q96DC8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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