Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DHX58Q96C10 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DHX58Q96C10 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms