Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3DQ96BQ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3DQ96BQ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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FAM3DQ96BQ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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