Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYAP1Q96A49 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYAP1Q96A49 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYAP1Q96A49 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms