Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NEIL2Q969S2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NEIL2Q969S2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms