Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD2Q969F2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD2Q969F2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD2Q969F2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms