Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GTF3C6Q969F1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF3C6Q969F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms