Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BHMTQ93088 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms