Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EDAQ92838 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDAQ92838 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDAQ92838 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDAQ92838 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDAQ92838 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDAQ92838 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EDAQ92838 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EDAQ92838 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EDAQ92838 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EDAQ92838 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDAQ92838 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDAQ92838 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDAQ92838 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDAQ92838 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EDAQ92838 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EDAQ92838 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms