Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PTPRUQ92729 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRUQ92729 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTPRUQ92729 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms