Protein–RNA interactions for Protein: Q92615

LARP4B, La-related protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4BQ92615 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LARP4BQ92615 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LARP4BQ92615 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LARP4BQ92615 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms