Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3CQ92520 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3CQ92520 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms