Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT1Q8TDG2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACTRT1Q8TDG2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT1Q8TDG2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms