Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CNIH3Q8TBE1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNIH3Q8TBE1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNIH3Q8TBE1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms