Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELBQ8NG08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms