Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEH6

MNS1, Meiosis-specific nuclear structural protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNS1Q8NEH6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MNS1Q8NEH6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MNS1Q8NEH6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms