Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3C3Q8NEB9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PIK3C3Q8NEB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms