Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms