Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP0

TTC13, Tetratricopeptide repeat protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13Q8NBP0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTC13Q8NBP0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTC13Q8NBP0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms