Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00612Q8N6U2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00612Q8N6U2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms