Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4M1

SLC44A3, Choline transporter-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A3Q8N4M1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC44A3Q8N4M1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC44A3Q8N4M1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms