Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NME8Q8N427 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME8Q8N427 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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